Закон частоты гамет может нарушаться в случае анеуплоидии (нарушении в геноме человека, при котором число хромосом не кратно нормальному, т.е. каких−то хромосом больше или меньше, чем нужно). Соответственно, аллелей становится в клетке организма либо больше, чем надо, либо меньше, и нарушается закон частоты гамет.