Для изучения строения и жизнедеятельности клеток применяют самые разнообразные методы. Исторически первым методом стала световая микроскопия. Потом открыли электронную микроскопию. Если требуется проследить за каким−либо химическим соединениемв клетке, то можно, применить метод радиографии. Для выделения и изучения отдельных органоидов клетки используют метод ультрацентрифугирования: разрушенные клетки помещают в пробирки и вращают с очень большой скоростью в особых приборах — центрифугах.